Aulas
El programa cuenta con tres aulas para la docencia, dos se encuentran en el CUCBA y una en el CUCS, además hay cinco que pueden ser utilizadas si alguna actividad lo requiere.
Además se dispone de las siguientes áreas:
Instalaciones
A) Aulas para presentación de exámenes de tesis.
B) Salas para donde se celebran reuniones de la junta académica y los profesores puedan realizar tutorías, asesorías y presentación de avance de tesis.
C) Auditorios con capacidad para 118, 112, 600 y 754 personas.
D) Videoaula.
E) Centros de cómputo con equipo de acceso a los estudiantes, salas con computadoras de apoyo a la docencia, seminarios, talleres y realizar teleconferencias.
F) Todos los profesores cuentan con cubículos.
G) Todas las instalaciones incluyendo las aulas tienen acceso a internet fijo e inalámbrico.
Oficinas de los profesores
Los profesores de tiempo completo y de tiempo parcial cumplen con los requisitos de infraestructura, ya que cuentan con cubículos, muebles y equipamiento informático y electrónico de calidad.
Biblioteca de la Maestría en Ciencias de la Salud Ambiental
La maestría cuenta con un acervo bibliográfico disponible para los alumnos y profesores, dentro de las instalaciones de la sede por parte del Centro Universitario de Ciencias Biológicas y Agropecuarias en las instalaciones de la Maestría.
Este acervo cuenta con 485 documentos entre los que se tienen revistas científicas especializadas, libros y archivos digitales (Colección Bibliográfica y Audiovisual con 315 documentos digitales de 1988 al 2015 por la Unión Internacional para la Conservación de la Naturaleza, UICN). Además se integran las publicaciones generadas por los investigadores del Núcleo Académico Básico.
Vehículo de apoyo a las actividades de investigación, docencia y vinculación de la Maestría en Ciencias
Se cuenta con un vehículo de la Universidad de Guadalajara, adquirido para la Unidad de Salud Ambiental Infantil del Instituto Regional de Investigación en Salud Pública (IRISP), adscrito al Departamento de Salud Pública del Centro Universitario de Ciencias de la Salud (CUCS).
Este vehículo fue financiado por la Comisión para la Cooperación Ambiental de América del Norte mediante la gestión realizada por el Dr. Felipe Lozano Kasten, profesor del Grupo Núcleo de la Maestría en Ciencias de la Salud Ambiental y Director del IRISP en colaboración con el Dr. Enrique Cifuentes, profesor investigador de la Harvard School of Public Health para el desarrollo de los trabajos de investigación-acción participativa que se llevan a cabo en las comunidades de la ribera de Chapala por el grupo de investigadores, profesores y estudiantes de la Maestría en Ciencias de la Salud Ambiental.
Cuenta con un chofer especialmente contratado para el manejo del vehículo, hace recorridos por las comunidades con una frecuencia mínima de tres veces a la semana. Es una camioneta tipo vagoneta, con capacidad para 8 personas y para el traslado de materiales de diagnóstico y equipo portátil para tomas de muestras ambientales.